进料加工，是指有进出口经营权的企业，为了加工出口货物而用外汇从国外进口原料、材料、辅料、元器件、配套件、零部件和包装材料（以下称进口料件），经加工生产成货物收回后复出口的一种出口贸易方式。
进料加工复出口货物的退税办法与一般贸易出口货物退税办法基本上是一致的，但由于进料加工复出口货物在料件的进口环节存在着不同的减免税，因此，同属采用作价加工方式使用的进口料件加工生产的货物，对已实行减免税的进口料件必须实行进项扣税，使复出口货物的退税款与国内实际征收的税款保持一致，因此，在计算复出口货物退税时，如按增值税、消费税适用退税率（税额）计算退税，而不考虑进口料件实际上并未全额征税的因素，将会出现把进口料件在进口环节已减免的税款也退给企业，造成多退税的现象。
为了加强对进料加工复出口货物退（免）税的管理，对不同形式的进料加工复出口货物分别按不同的办法处理。
生产企业以“进料加工”贸易方式进口料、件加工复出口的，对其进口料件应先根据海关核准的《进料加工登记手册》填具“进料加工贸易申请表”，报级主管其出口退税的税务机关同意盖章后，再将此申请表报送主管其征税的税务机关，并准许其在计算加工成品的增值税时对这部分进口料、件按规定征税税率计算税额予以抵扣（通常称之为虚拟进项税额，从当期的应纳税额中扣减）。
货物出口后，比照一般出口货物实行退（免）税，主管退税的税务机关在计算其退税或免税额时，应对这部分进口料件规定退税税率计算额并予扣减。
当期不予抵扣或退税的税额=当期出口货物离岸价×外汇人民币牌价×（征税率-退税率）-当期海关核销免税进口料件组成计税价格×（征税率-退税率）
当期应纳税额=当期内销货物销项税额-（当期全部进项税额-当期不予抵扣或退税的税额）
生产企业未按规定向税务机关申请办理“进料加工贸易申请表”的进料加工业务，税务机关在计算当期应纳税额，应退税额或当期不予抵扣或退税的税额时，均不予抵扣当期海关核销免税进口料件组成计税价格按规定征税税率或退税税率计算的税额。
税务机关依以下公式计算税款：
当期不予抵扣或退税的税额=当期出口货物离岸价格×外汇人民币牌价×（征税率-退税率）-事后发现海关核销免税进口料件组成计税价格×（0-退税率）
当期应纳税额=当期内销货物销项税额-（当期全部进项税额-当期不予抵扣或退税的税额）