初次使用申报系统时必须对系统参数进行配置，需要修改内容如下：
设置系统备份路径。
设置电子口岸IC卡号和密码（法人卡操作员卡均可）。
无纸化企业需要配置数字签名以及设备密码。
18位报关单执行日期（全国18位报关单执行日期分为四种，2011年6月1日、7月1日、8月1日、9月1日，咨询主管税务机关修改日期）。
配置当地出口综合服务平台(远程网)链接及密码。
山东、广州无纸化企业需要对应勾选山东/广州无纸化。