辅导期一般纳税人对收取的增值税专用发票实行“先比对，后抵扣”，“先比对，后抵扣”是指辅导期一般纳税人企业取得的增值税进项发票认证后，先通过防伪税控系统将认证信息上传至国家税务总局进行比对，总局比对结束后将比对结果下发各省市，各主管国税局将比对无误的信息通知辅导期一般纳税人企业进行抵扣（在认证的次月收到比对结果并抵扣）。
帐务处理：在应交税金科目下增设“待抵扣进行税额”二级科目。
企业认证后 借：库存商品（或其他相关科目） 借：应交税金-待抵扣进行税额 贷：银行存款（或其他相关科目） 收到比对结果后 借：应交税金-应交增值税（进项税额） 贷：应交税金-待抵扣进行税额 认证的当月填在附表二24行“本期认证相符且本期未申报抵扣”栏，次月收到比对结果（《稽核通知书》）后方可抵扣（《稽核通知书》一般在认证次月月末收到，特殊情况会更晚一些，但申报期内肯定能购收到，因此认证的次月必须抵扣），抵扣数额填在附表二第3行“前期认证相符且本期申报抵扣”栏。