关税配额制，将征收关税与进口配额结合起来，以限制外国商品输入的一种制度。它由政府规定一定时期内某种商品的关税配额，凡属在配额范围内进口的商品，课以较低的关税；凡属在配额范围外进口的商品，则课以较高的关税。
可分为优惠性关税配额和非优惠性关税配额。前者对在配额范围内进口的商品，给予减征免征关税的优惠，对在配额范围外进口的商品，按普通关税税率课征。后者则对在配额范围内进口的商品，按普通关税税率课征，对在配额范围外进口的商品，除按普通关税税率课征以外，还要课征高额的附加税或者罚款。有的国家出于国内政策需要，还有采用国别关税配额的，其目的是为了有选择地限制从某些特定国家或地区进口的商品。
关税配额制最初是作为保护本国同类产品生产和国内市场的一种防御性措施，后来则被一些发达国家用以作为争夺国外市场和实行贸易歧视政策的一种进攻性手段。