透支保函是指的是银行为国内法人驻外机构向当地银行申请开立透支账户而开具的银行保函，以保证申请人按照透支契约的规定及时补足透支金额。若申请人未能如期补足透支金额，开具透支保函的银行有义务代为补足透支金额。
银行因本国承包商或其他商人的委托向外国银行开立的保证委托人(被保证人)及时向受益人(外国银行)补足所透支的金额的保证文件。
一般来说，当一国的承包工作公司在另一国家施工，或一国的公司派往另一国的分支机构开展业务时，为了得到当地银行的资金融通，常在当地银行开立透支帐户，由当地银行提供一定的透支限额。在开立透支帐户时，通常须提供该承包公司或分支机构的总公司所在地银行出具的担保，保证该公司按透支合同的规定及时向银行补足所透支的金额，否则，将由担保银行代为补足。