经费结余，是指主要依靠政府拨款的事业单位年终尚未列支的拨款结余。
为了核算行政单位年度预算执行结果，应当设置“经费结余”帐户。该帐户属净资产类(基金类)。“经费支出”帐户只有在年终结帐时才有帐务处理。年终，将“拨入经费”的余额转入本帐户贷方，即借“拨入经费”，贷“经费结余”；将“经费支出”的余额转入本帐户借方，即借“经费结余”，贷记“经费支出”。年终结帐时，将经费结余净余额转入“普通基金”帐户，借记“经费结余”，贷记“普通基金”，结余一旦形成，就可并入普通基金供行政单位周转使用。结转后，本帐户应无余额。
1.年终，某行政单位结转“拨入经费”贷方余额85000元。
借：拨入经费 85000
贷：经费结余 85000
2.年终，将单位“经费支出”贷方余额79000元结转到“经费结余”。
借：经费结余 79000
贷：经费支出 79000
３．经计算，将“经费结余”贷方余额6000元转入“普通基金”帐户。
借：经费结余 6000
贷：普通基金 6000