电子口岸执法系统是利用现代信息技术，借助国家电信公网，将进出口业务信息流、资金流、货物流的电子底帐数据集中存放到一个公共数据中心，使国家行政管理部门可以进行跨部门、跨行业联网数据核查，企业可以上网办理报关、出口退税、结售汇核销等手续。该系统推广使用后，可为企业提供全天候、全方位网上服务，以加快报关通关、出口收汇核销、出口退税速度，减少企业奔波劳累之苦，使进出口业务更方便、更快捷，从而大大提高贸易效率，降低贸易成本。
该系统主要包括通关管理、出口收汇管理、加工贸易管理、出口综合管理、企业综合管理以及其他综合业务。具体是：给政府管理部门提供报关单、出口收汇核销单、舱单、进口汽车证明、增值税发票和专用税票以及各类进出口许可证件等电子底帐联网核查、核注、核销等应用项目，以及企业在网上办理进出口报关、出口交单、出口退税等业务的应用项目。