世界贸易组织的谈判委员会则是在总理事会或分理事会下设的负责各具体谈判议题的委员会（有的也称作谈判组，如基础电讯谈判组，自然人移动谈判组，海运谈判组等），如民用航空器委员会、政府采购委员会、市场准入委员会、农业委员会、卫生与植物检疫措施委员会、与贸易有关的投资措施委员会、原产地规则委员会、补贴与反补贴委员会、海关估价委员会、金融服务贸易委员会、专业服务委员会等。
世界贸易组织在启动多哈回合谈判时，建立了一个特别的谈判机制----设立贸易谈判委员会(Trade Negotiations Committee， TNC)，经总理事会授权，谈判将由贸易谈判委员会负责监督。该委员会在2002年2月1日设立并举行首次会议，建立相应的谈判机制，谈判委员会下设8个谈判小组：农业谈判小组、服务贸易谈判小组、非农产品市场准入谈判小组、贸易规则谈判小组、知识产权谈判小组、争端解决谈判小组、贸易与环境谈判小组、贸易与发展谈判小组。各谈判小组确定了谈判的主要议题、焦点、目标、方式和日期。